1、真核生物基因组指一个物种的单倍体染色体组(1n)所含有的一整套基因.还包括叶绿体、线粒体的基因组. 　　原核生物一般只有一个环状的DNA分子,其上所含有的基因为一个基因组. 　　2、原核生物的染色体分子量较小,基因组含有大量单一顺序（unique-sequences）,DNA仅有少量的重复顺序和基因. 　　真核生物基因组存在大量的非编码序列.包括：.内含子和外显子、.基因家族和假基因、重复DNA序列.真核生物的基因组的重复顺序不但大量,而且存在复杂谱系. 　　3、原核生物的细胞中除了主染色体以外,还含有各种质粒和转座因子.质粒常为双链环状DNA,可独立复制,有的既可以游离于细胞质中,也可以整合到染色体上.转座因子一般都是整合在基因组中. 　　真核生物除了核染色体以外,还存在细胞器DNA,如线粒体和叶绿体的DNA,为双链环状,可自主复制.有的真核细胞中也存在质粒,如酵母和植物.